1917 — дата образования Пономаренковского сельского Совета депутатов трудящихся в составе ... волости Харьковского уезда Харьковской губернии Российской республики.
С 1923 года — в составе Харьковского района Харьковского округа, с 1932 — Харьковской области УССР.
После ВОВ входивший в сельсовет хутор Затейный, имевший в 1940 году 17 дворов, был объединён с хутором Боровой, имевшим 5 дворов, в село Боровое (Харьковский район).
В 1959 году село Чунихи (Чунухи, хутор Чунихин), расположенное на левом берегу реки Жихорец и имевшее в 1940 году 11 дворов, было включено в черту Харькова.
В начале 1967 года в сельсовет входили 10 населённых пунктов.
Между 1967 и 1975 годами село Коммунар (до 1950 Котляры) было исключено из состава сельсовета, перейдя в состав Безлюдовский поссовет, а затем образовав в 1992 свой Коммунарский, с 2016 — Котляровский сельский совет.
В 1976 году в сельсовет входили девять населённых пунктов.
После 1976 года село Молчаны было исключено из состава сельсовета, войдя в 1992 в Коммунарский сельский совет.
В 2012 году три села — Горбани, Павленки, Федорцы (сверху вниз по течению Жихорца), согласно постановлению ВР «Про изменение и установление границ Харькова, Дергачёвского и Харьковского районов Харьковской области» от 6 сентября 2012 года № 5215-VI были включены в городскую черту Харькова, согласно постановлению от 06.09.2012 года № 5215-VI, 809 гектаров земель совета были присоединены к городу Харькову.
24 января 2013 года Пономаренковский сельский совет исключил из своего состава данные три села.
5 марта 2013 года Харьковский областной совет исключил из учётных данных сёла Горбани, Павленки и Федорцы.
После 17 июля 2020 года в рамках административно-территориальной реформы по новому делению Харьковской области данный сельсовет был ликвидирован; входящие в него населённые пункты и его территории присоединены к Харьковская городская община Харьковского района.
Пономаренковский сельсовет просуществовал 103 года.
