Купянск находился под полным контролем российских войск с 27 февраля по 10 сентября 2022 года. Несмотря на разрушение украинскими войсками тремя днями ранее (24 февраля) железнодорожного моста, что должно было затруднить наступление российских сил, город был сдан мэром Купянска Геннадием Мацегорой в обмен на прекращение боевых действий (на следующий день правительство Украины предъявило Мацегоре обвинение в госизмене, а 28 февраля мэр был арестован украинскими властями[9]). Новым пророссийским мэром города стал Максим Губин. С момента оккупации Купянск фактически являлся резиденцией Харьковской ВГА.
8 сентября Генштаб ВСУ заявил о прорыве российской линии обороны на отдельных участках Харьковского направления и освобождении 20 населённых пунктов Харьковской области. В тот же день российские власти заявили о начале обороны города от наступавших из Шевченкова украинских сил и входа в Купянск дополнительных российских подразделений. Вечером ВСУ вошли в западные районы города, а утром 9 сентября под контроль украинских сил перешло здание городского совета. В тот же день правительство Украины заявило об освобождении Купянска, а мэр Максим Губин сбежал из города в Россию. Однако представители ВС РФ опровергли заявление украинской стороны, сообщив об эвакуации своих сил на восточный берег реки Оскол, а также подорвав соединяющий части города мост.
10 сентября ВСУ заняли восточную часть города, а 16 сентября был взят под контроль Купянск-Узловой с его железнодорожной станцией.
В конце 2023 года в попытках сил РФ наступать на Купянск участвуют 138-я, 27-я, 25-я мотострелковые бригады, 11-й и 15-й мотострелковые полки ВС РФ
